Тру­бец­кой бежал от ре­во­лю­ции через Кон­стан­ти­но­поль в Вену, где стал про­фес­со­ром Вен­ско­го уни­вер­си­те­та. Тесно со­труд­ни­чая с Ро­ма­ном Якоб­со­ном и Праж­ским линг­ви­сти­че­ским круж­ком, он раз­ра­бо­тал си­сте­му фо­но­ло­ги­че­ских оп­по­зи­ций — прин­цип, объ­яс­ня­ю­щий, как звуки языка раз­ли­ча­ют слова.

«Основы фо­но­ло­гии» (Grundzüge der Phonologie, 1939) — итог его работы. Книга вышла через год после его смерти и немед­лен­но стала клас­си­кой. Се­го­дня фо­но­ло­ги­че­ские методы Тру­бец­ко­го ис­поль­зу­ют­ся в опи­са­нии сотен языков мира.

Тру­бец­кой был и фи­ло­со­фом куль­ту­ры. В эми­гра­ции он стал одним из ос­но­ва­те­лей евразий­ско­го дви­же­ния — фи­ло­со­фии, утвер­ждав­шей, что Россия — особая ци­ви­ли­за­ция, не Запад и не Восток, а «Евра­зия». Его книга «Европа и че­ло­ве­че­ство» (1920) кри­ти­ко­ва­ла ев­ро­по­цен­тризм и стала ма­ни­фе­стом этого дви­же­ния.