Дубна — город учёных на Волге — стала точкой притяжения для физиков из стран Восточного блока. Чехословацкие исследователи работали здесь бок о бок с советскими коллегами над задачами ядерной физики. Объединённый институт ядерных исследований (ОИЯИ), основанный в 1956 году, объединил специалистов из 18 стран.

Чехословакия была одним из ключевых членов ОИЯИ: её учёные участвовали в экспериментах на ускорителях, публиковали совместные статьи, а сам институт выдавал дипломы доктора наук, признанные в Праге.

В 1957 году в чешском Ржеже заработал первый ядерный реактор Чехословакии — построенный при советской технической помощи. Реактор ВВР-С стал основой для Ядерного физического института ЧСАН и дал старт чехословацкой ядерной программе.

Советско-чехословацкое сотрудничество распространялось и на другие области: полимерная химия, геохимия, биофизика. Совместные экспедиции, общие лаборатории, программы обмена аспирантами — всё это создавало живую ткань научного сотрудничества.